กลุ่ม A
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 นาโกย่า แกรมปัส เอต นาโกย่า แกรมปัส เอต 6 5 0 1 9 15
2 วิสเซล โกเบ วิสเซล โกเบ 6 3 1 2 0 10
3 เกียวโต แซงก้า เกียวโต แซงก้า 6 1 3 2 -1 6
4 อูราวะ เรด ไดมอนส์ อูราวะ เรด ไดมอนส์ 6 0 2 4 -8 2
กลุ่ม B
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 ชิมิสุ เอส-พัลส์ ชิมิสุ เอส-พัลส์ 6 3 2 1 7 11
2 เอฟซี โตเกียว เอฟซี โตเกียว 6 3 2 1 5 11
3 จูบิโล อิวาตะ จูบิโล อิวาตะ 6 3 1 2 3 10
4 โตเกียวเวอร์ดี้ โตเกียวเวอร์ดี้ 6 0 1 5 -15 1
กลุ่ม C
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 เจอีเอฟ ยูไนเต็ด อิชิฮารา เจอีเอฟ ยูไนเต็ด อิชิฮารา 6 3 3 0 4 12
2 คาชิว่า เรย์โซล คาชิว่า เรย์โซล 6 2 3 1 2 9
3 คาวาซากิ ฟรอนตาเล่ คาวาซากิ ฟรอนตาเล่ 6 2 0 4 -1 6
4 คอนซาโดล ซัปโปโร คอนซาโดล ซัปโปโร 6 1 2 3 -5 5
กลุ่ม D
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 โยโกฮาม่า เอฟ มารินอส โยโกฮาม่า เอฟ มารินอส 6 3 3 0 6 12
2 โออิตะ ตรินิต้า โออิตะ ตรินิต้า 6 3 2 1 4 11
3 อัลบิเร็กซ์ นิงาตะ อัลบิเร็กซ์ นิงาตะ 6 0 4 2 -4 4
4 โอมิยะ อาร์ดิย่า โอมิยะ อาร์ดิย่า 6 0 3 3 -6 3
ทีมที่มาร์คด้วยสีแดงได้รับการรับรองให้ผ่านเข้ารอบเรียบร้อยแล้ว